醫學院非常重視研究協作；學院和學系是大學不可分割的一部分，就正如大學是社會和國際學術界的一分子。不論在區域或國際上，我們世界一流的研究人員參與大量合作研究計劃、公私營合作、世界級研討會和座談會、社區工作坊和公眾教育。
卓越學科領域
- 鼻咽癌研究中心（2010）項目統籌：龍李梅瑞教授
- 大流行流感及普通流感的控制（2008）項目統籌：裴偉士教授
- 發育基因組學和骨骼研究（2004）項目統籌：謝賞恩教授
- 香港代謝醫學研究所（2019）項目統籌：徐愛民教授
主題研究計劃
項目統籌：高本恩教授（2019）
項目統籌：盧寵茂（2019）
項目統籌：陳志偉教授（2018）
項目統籌：龍李梅瑞教授（2017）
項目統籌：梁雪兒教授（2016）
項目統籌：吳呂愛蓮教授（2016）
項目統籌：胡釗逸教授（2015）
項目統籌：譚廣亨教授 （2014）
項目統籌：裴偉士教授（2014）
項目統籌：謝賞恩教授（2012）
項目統籌：謝鴻發教授（2011）
世衛H5參考實驗室
香港大學流感研究中心是全球指定12間世衞H5參考實驗室之一，旨在針對H5及其他可能人畜共通的動物流感病毒，提供國際參考實驗室服務及培訓，並向世衞提供關於人畜感染威脅的數據和風險評估，以及對相關疫苗開發之建議。港大實驗室參與每年兩次的世衞流感疫苗株篩選會議。實驗室多年來為印尼、泰國、越南、印度、斯里蘭卡和柬埔寨等國家提供協助和培訓。
世衞H5參考實驗室網站：http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/h5_reflabs/en/