生物安全三級實驗室
最先進的生物安全三級實驗室和動物設施，可供研究人員使用，進行微生物學、病毒學和流行病學研究。
比較醫學研究中心（CCMR）
比較醫學研究中心（CCMR）提供優質的實驗動物作教學或科研之用，並致力推動正確對待及愛護研究動物，中心獲推動人道對待及負責任使用實驗室動物的國際組織AAALAC認證。
泛組學科研中心（CPOS）
泛組學科研中心（CPOS）由香港大學李嘉誠醫學院成立，以策略性支援組學的研究：
- 加強為研究人員提供和開發最先進的核心技術平台和技術支援；
- 加強研究和培訓內容，以回應多組學大數據湧現（基因組學、轉錄組學、表觀基因組學、代謝組學、蛋白質組學、微生物組學等）；以及
- 透過採取全貌方針的策略研究計劃，全面了解健康和疾病的機制，並促進預防、診斷和治療措施的發展。
了解泛組學科研中心：
行政架構
生物樣本庫設施
基因組學設施
蛋白質組學及代謝物組學設施
生物訊息設施
成像及流式細胞術設施
生物研究支援設施
生物試劑及耗材採購設施
李嘉誠低溫電子顯微設施實驗室
香港大學細胞治療實驗室
香港大學臨床試驗中心（HKU-CTC）
香港大學臨床試驗中心（HKU-CTC）是學術臨床研究機構，並獲授權為中央平台，管理及統籌港大及教學醫院——瑪麗醫院的臨床研究。
生物訊息學、生物統計學及臨床研究方法學諮詢服務
生物統計學及臨床研究方法學部門（Biostatistics and Clinical Research Methodology Unit）提供專家意見，以支援醫學院的研究活動。部門亦為公共機構和私營公司提供統計諮詢。
分子成像及醫學迴旋加速器中心
分子成像及醫學迴旋加速器中心（Molecular Imaging and Medical Cyclotron Centre）及其合作伙伴，致力提供最先進的醫學及分子成像服務，以支援港大醫學院內外的研究人員，進行優質基礎和轉化研究。
國家重點實驗室（SKLs）
醫學院現時擁有四個獲科技部批准的國家重點實驗室，與內地的國家重點實驗室緊密合作。
生物醫藥技術國家重點實驗室
腦與認知科學國家重點實驗室（與港大社會科學學院共同主理）
新發傳染性疾病國家重點實驗室
肝病研究國家重點實驗室
轉基因核心設施（CCMR-TCF）
轉基因核心設施（CCMR-TCF）是比較醫學研究中心的一部分，透過胚胎／精子冷凍來保存轉基因小鼠品系，以輔助生殖技術重新繁衍和拯救小鼠族群，以及產生新的轉基因和基因靶向小鼠，以支援研究人員研究各種疾病模型。設施旨在提供高效率的中央化服務，以支持香港大學有關轉基因動物的前沿研究。
世衞傳染病流行病學及控制合作中心
公共衞生學院獲委任為世衞傳染病流行病學及控制合作中心，是港大第一所獲世衞委任為合作中心的學術部門。